Como en muchas camisetas de fútbol y del deporte en general, poseen la existencia de un escudo en la misma, como un símbolo más de la institución.

A través del tiempo el escudo de Zafiro FC a sufrido modificaciones.

- En 2009, el escudo era bicolor Azul y celeste y en medio las letras ZFC

- En 2010, cambia drasticamente de colores por un rojo oscuro y naranja.

- En 2011, Cambia la forma, un escudo redondo, conservando todo lo anterior, pero se agregan unos laureles dorados, en señal de gloria.

 - En 2014, Se cambia el circulo por un hexagono vertical y los laureles por el rostro de un león.

- En 2017, hasta la actualidad, se han modernizados las formas, cambiando el rostro del león por la de un zorro como simbolo de inteligencia y astucia.

El escudo esta siempre del lado izquierdo, (del rojo) dicho por los hinchas y simpatizantes “del lado del corazón”. 

La bandera de Zafiro FC, representa los colores del club. Naranja y rojo oscuro administrados en partes iguales, puede verse tanto de forma vertical como horizonal.

Suele verse dentro de ella inscripciones o leyendas, generalmete con letras de color blanco, alentando y apoyando al equipo, Y otras indicando el nombre del barrio que viene a hacer el aguante tanto de local como de visitante, donde generalmente copan todas las tribunas llenandolas de un colorido tan festivo.

En sus comienzos (2009), tanto el escudo como la camiseta titular, tenia los colores Azul y celeste. Al poco tiempo se cambio por los colores actuales naranja y rojo oscuro. (ver "HISTORIA")